Зимнее расписание будет действовать до 28 марта 2009 года включительно.
В этом сезоне S7 Airlines продолжит выполнение рейсов, которые были открыты в летний период 2008 года, но не выполнялись прошлой зимой. Это маршруты Москва-Дублин, Москва-Красноярск, Москва-Екатеринбург, Москва-Братск и Новосибирск-Бишкек.
В период действия зимнего расписания S7 Airlines увеличит частоту полетов по следующим направлениям: Москва-Баку (Азербайджан), Москва-Киев (Украина), Москва-Кишинев (Молдавия), Москва-Краснодар, Москва-Самара, Москва-Санкт-Петербург, Москва-Новый Уренгой, Москва-Уфа, Москва-Хабаровск, Москва-Владивосток и Новосибирск-Дубай (ОАЭ).
Зимняя чартерная программа полетов S7 Airlines включает традиционные направления - Хургада, Шарм эль Шейх (Египет), Дубай (ОАЭ), Барселона, Аликанте, Тенерифе (Испания), Овда (Израиль), Пловдив (Болгария), Зальцбург (Австрия), Ларнака (Кипр), Шамбери и Нант (Франция). В Италию, кроме рейсов в Римини и Анкону, S7 Airlines будет выполнять новый рейс в Турин.