15 февраля 2012 года в отношении Дерева возбудили дело о мошенничестве. По данным следствия, с декабря 2006 года по октябрь 2010-го Дерев, являясь учредителем, акционером и руководителем двух компаний и осуществляя руководство созданной им группой, в которую входили еще шесть человек, похитил более 119 млн рублей из бюджета РФ путем незаконного возмещения НДС.
Дерева арестовали в марте 2018 года, вину в инкриминируемом ему преступлении не признал. 1 марта 2019 года суд освободил его из СИЗО в связи с истечением предельного срока содержания под стражей. В начале октября 2020 года Дерев был задержан в Ставрополе, суд арестовал его на два месяца, заменив позже меру пресечения на подписку о невыезде.
Дерев связывал свое уголовное преследование с конфликтом с влиятельным в регионе кланом Арашуковых. В 2012 году Дерев в интервью «Российской газете» заявил о причастности Арашуковых к политическим убийствам в Карачаево-Черкесии. Спустя неделю после выхода этой публикации было возбуждено дело о мошенничестве с возвратом НДС. А после того как Дерева в кресле сенатора сменил Рауф Арашуков, экс-сенатор был задержан и арестован, сообщает РБК.
В свою очередь, освобождение Дерева произошло через месяц после скандального задержания Рауфа Арашукова прямо на заседании Совета Федерации, на котором присутствовали глава СКР Александр Бастрыкин и генпрокурор Юрий Чайка. Одновременно с Арашуковым был задержан его отец, советник главы «Газпрома» Рауль Арашуков. Впоследствии СКР задержал еще множество их родственников и руководителей их бизнес-структур, связанных с кавказскими подразделениями «Газпрома».
Справка:
Дерев Вячеслав Эдуардович родился 20 августа 1949 года в ауле Адыге-Хабль (Адыге-Хабльский район, КЧАО).
В 1971 году окончил Карачаево-Черкесский политехнический институт. В 2012 году окончил Северо-Кавказскую государственную гуманитарно-технологическую академию.
Являлся депутатом Народного Собрания КЧР Народного Собрания II и IV созыва.
Работал президентом ООО "Холдинг "Меркурий-Агро".
С апреля 2011 года -член Совета Федерации Федерального Собрания Российской Федерации от Карачаево-Черкесской Республики.
С апреля по ноябрь 2011 года – член комиссии СФ по естественным монополиям, с мая 2011 по ноябрь 2011 года – член Комитета СФ по аграрно-продовольственной политике и рыбохозяйственному комплексу, с ноября 2011 года – член Комитета СФ по аграрно-продовольственной политике и природопользованию.
27 января 2016 года Совфед досрочно прекратил полномочия сенатора от Карачаево-Черкесии Дерева. Сообщалось, что он написал заявление об уходе по собственному желанию.
5 марта 2018 года задержан в своём доме в посёлке Псыж и по ходатайству следствия этапирован в Москву в центральный аппарат Следственного комитета по делу о хищении 119,3 млн рублей бюджетных средств путём незаконного возмещения НДС. Решением суда арестован на два месяца.
1 марта 2019 года Московский городской суд отказался удовлетворить ходатайство следствия о новом продлении ареста Дерева на два месяца, и он был освобождён в зале суда.
5 октября 2020 года решением Октябрьского районного суда Ставрополя ввиду неявки Дерева на судебные заседания мерой пресечения вновь избрано содержание под стражей, и он был задержан.
