В отношении Слепцова возбуждено уголовное дело по признакам состава преступления, предусмотренного ч.3 ст.285 УК РФ (злоупотребление должностными полномочиями, повлекшее тяжкие последствия). Кроме того, он обвиняется по ч.4 ст.159 УК РФ (мошенничество, совершенное группой лиц по предварительному сговору с использованием своего служебного положения, в особо крупном размере). Оба дела объединены в одно производство.
По данным следствия, в период с 2016 года из федерального бюджета для обучения в университете 136 студентов выделено и перечислено более 250 млн рублей. Фактически же данные студенты в образовательное учреждение не поступали и обучение в нем не проходили.
Как полагает следствие, ректор с работниками ВУЗа обеспечили внесение ложных сведений в документы учреждения, по которым они переводились на последующие курсы, откуда по достижении четвертого курса отчислялись в связи с неуспеваемостью. Что касается выделенных на обучение денежных средств, они изымались должностными лицами из числа руководства Арктического госуниверситета на цели, не связанные с обучением студентов.
В конце ноября 2020 года Иван Слепцов был взят под стражу и помещен в СИЗО, в котором находился до февраля этого года. 17 февраля 2021 года якутский городской суд изменил меру пресечения в отношении Слепцова на домашний арест.
