По итогам проведения "РусГидро" технологического и ценового аудита проектов объектов электроэнергетики Восточной Сибири и Дальнего Востока сметная стоимость некоторых объектов превысила их предельную оценочную стоимость. Сметная стоимость строительства Сахалинской ГРЭС-2 (первая очередь) превысила предельную оценочную стоимость на 18,4 миллиарда рублей и составила 34,7 миллиарда, Якутской ГРЭС-2 - на 7,3 миллиарда рублей и составила 26,2 миллиарда.
По данным Счетной палаты, по итогам первого квартала 2015 года на строительство объектов электроэнергетики использовано 20,7 миллиарда рублей из 50 миллиардов или 41% средств федерального бюджета, внесенных в качестве взноса в уставной капитал компании. При этом общая сумма процентов, полученная "РусГидро" от размещения бюджетных средств на депозиты в частности в ОАО "Сбербанк России" за период 2013-2015 годов, составила более 10 миллиардов рублей.