В проекте Генплана указано, что помимо продления Сокольнической и Калининско-Солнцевской линии запланирована прокладка двух новых веток метро. Линия из поселения Рязановское пройдет в районы Бирюлево Западное и Восточное и дойдет до Нагатинского Затона. Еще одна ветка соединит Троицк, Третий пересадочный контур (через станцию «Улица Новаторов») и центр Москвы.
В Новой Москве также построят 60 км железных дорог и модернизируют 48,6 км Большого кольца Московской железной дороги. Еще 178 км путей будут обслуживать скоростные и обычные трамваи. Причем линию протяженностью 12 км в административно-деловой центр Коммунарка решено сделать не скоростной, а обычной.
После согласования проект Генплана будет внесен мэром как законопроект в Мосгордуму.