Георгий Маргвелашвили родился 4 сентября 1969 года в Тбилиси.
В 1992 году окончил факультет философии и психологии Тбилисского Государственного университета им. Иванэ Джавахишвили, в 1993-1994 годах изучал социологию в в Университете Центральной Европы. Доктор философии.
С 1992 года по 1995 год работал гидом в туристической компании (специализация — горный туризм), ассистентом менеджера в издательстве.
В 1994-1995 годах был начальником департамента по маркетингу компании "Бизнес дневники".
В 1996-1997 годах преподавал философию в Тбилисском независимом университете.
В 1995-2000 годах работал в Национальном демократическом институте международных отношений специалистом (консультантом программы).
В 2000-2012 годах работал в Институте общественных дел Грузии GIPA, в том числе на должности ректора в 2000-2006 и 2010-2012 годах.
С 2006 года 2010 год занимал должность начальника департамента исследований GIPA.
В октябре 2012 года занял пост министра образования Грузии в правительстве Бидзины Иванишвили, лидера победившей на парламентских выборах 1 октября 2012 года коалиции "Грузинская мечта". При этом сам Маргвелашвили не является членом какой-либо политической партии.
7 февраля 2013 года был назначен вице-премьером грузинского правительства.
11 мая 2013 года правящая коалиция "Грузинская мечта" назвала Георгия Маргвелашвили своим кандидатом в президенты Грузии на выборах 27 октября 2013 года.
16 июля 2013 года ушел в отставку с поста министра образования, оставшись на посту вице-премьера Грузии.
В совершенстве владеет русским и английским языками.
Не женат, есть дочь.
