Государственная программа предусматривает ускоренное развитие региона, создание в нем конкурентоспособной диверсифицированной экономики и улучшение социально-демографической ситуации на его территории.
В состав госпрограммы включены две федеральные целевые программы и одиннадцать поддпрограмм.
Федеральные целевые программы: «Экономическое и социальное развитие Дальнего Востока и Байкальского региона на период до 2018 года» и «Социально-экономическое развитие Курильских островов (Сахалинская область) на 2007-2015 годы».
Подпрограммы касаются повышения эффективности экономики региона, развития минерально-сырьевого комплекса, лесопромышленного комплекса, рыбной промышленности, агропромышленного комплекса, транспортной и энергетической инфраструктуры, создания условий для комфортного проживания населения, охраны окружающей среды, развития туризма, а также научного и кадрового обеспечения реализации госпрограммы.