В конце сентября Путин объявил Говоруну выговор за неисполнение президентских поручений из указов, подписанных после инаугурации. По мнению чиновника, близкого к администрации президента, на самом деле Путин был недоволен работой Говоруна во время ликвидации последствий июльского наводнения в Крымске. Говорун возглавлял специально созданную правительственную комиссию, а на деле президенту пришлось самому заниматься урегулированием ситуации, а это обязанность министра, пишут "Ведомости".
От Говоруна в Минрегионе ждали изменений, говорил изданию сотрудник министерства: надеялись, что поменяются тактика и стратегия, полномочия и штат. Предполагалось, что у министра появятся дополнительно восемь замов, каждый из которых будет курировать федеральный округ. Пока назначены двое — Сергей Верещагин, который курирует Северный Кавказ, и Сергей Дарькин для работы с Приволжским округом.
Минрегион — проблемное ведомство, еще до смены правительства чиновники рассказывали о планах раздела министерства на Минстрой, который бы занялся вопросами жилья и ЖКХ, и Министерство по делам национальностей. Когда стало известно о переходе Говоруна с поста полпреда в Центральном федеральном округе в министерство, чиновники и эксперты предполагали, что у Минрегиона появятся и политические функции.