Его преемником на посту руководителя учебного заведения ФСБ станет Николай Плотников, который прежде был заместителем Сысоева.
Академия ФСБ занимается подготовкой офицеров российских спецслужб и кадров для разведки дружественных государств.
Антитеррористический центр СНГ обеспечивает взаимодействие компетентных органов стран постсоветского пространства, входящих в Содружество Независимых Государств, в сфере противодействия международному терроризму и экстремизму. С 2006 года его возглавлял генерал-полковник полиции Андрей Новиков, который был замглавы МВД России.
Справка:

Сысоев Евгений Сергеевич родился в 1959 году в Томской области.
В 1982 году окончил физико-технический факультет Томского государственного университета имени В.В.Куйбышева. В 1984 году окончил Высшие курсы КГБ СССР в Минске. В 1993 году окончил юридический факультет Томского государственного университета.
С 1983 года начал проходить службу в органах государственной безопасности на различных должностях оперативного и руководящего (с 1988 года) составов в Управлении ФСБ России по Томской области. С 2000 года — заместитель начальника Управления.
С 2003 года — первый заместитель начальника Управления ФСБ России по Красноярскому краю.
В 2005—2009 годах — начальник Института ФСБ России (г.Новосибирск).
С 2009 года — начальник Управления ФСБ России по Новосибирской области, а также председатель совета начальников органов Федеральной службы безопасности в Сибирском федеральном округе.
С 2011 года — заместитель руководителя службы — начальник инспекторского управления Контрольной службы ФСБ России.
С 19 марта 2013 по 31 декабря 2015 года — заместитель директора ФСБ России — руководитель аппарата Национального антитеррористического комитета.
С 1 января 2016 по конец 2018 года — директор исполнительного комитета Региональной антитеррористической структуры Шанхайской организации сотрудничества.
28 декабря 2018 года назначен начальником Академии ФСБ России.
C 1 января 2022 года - руководитель Антитеррористического центра СНГ.
Награждён орденами: «Александра Невского», «За военные заслуги», «Почёта», медалями, иностранным Орденом Пакистана третьего класса.