Как доложил министр обороны президенту - Верховному главнокомандующему, Рособоронзаказ дублирует или частично дублирует функции ФАС, которая размещает заказы для государственных и муниципальных нужд, Счетной палаты, которая контролирует расходование бюджетных средств, а также межведомственной рабочей группы по предотвращению нарушений законности в сфере государственного оборонного заказа (ГОЗ).
Функции по контролю над расходованием денег предлагается передать Счетной палате; контрольные функции по размещению заказов по линии ГОЗ и ведение реестра недобросовестных поставщиков — ФАС России; а ведение реестра единственных поставщиков — Минпромторгу.
Шойгу не впервые обращается к руководству страны по этой теме. В январе 2014 года министр обороны направил аналогичное письмо на имя премьера Дмитрия Медведева, но тогда идее Шойгу воспротивился вице-премьер Дмитрий Рогозин, поскольку именно с его подачи в 2012 году Рособоронзаказ переводился в подчинение правительству для оптимизации работы всей структуры ГОЗ.
По данным эксперта РИА Новости, "шансы на сохранение Рособоронзаказа в нынешней конфигурации минимальны".