В навигацию 2012 года по указанию Шильцина судно «Амурская» было задействовано в перевозке золотосодержащей руды в северных районах Хабаровского края. При этом судовладельцу было достоверно известно, что теплоход не предназначался для перевозки навалочных (сыпучих) грузов, склонных к разжижению. Кроме того, загрузка рудой проводилась недопустимым методом осушения, то есть путем постановки сухогруза на грунт во время отлива и снятия судна после загрузки во время прилива.
28 октября 2012 года на сухогруз было погружено более 700 тонн руды, что на 100 тонн превышало максимальную грузоподъемность судна. Перед выходом «Амурской» в рейс капитан доложил Шильцину о неблагоприятном прогнозе погоды на ближайшие дни плавания, однако, преследуя цель максимального извлечения прибыли от перевозки руды, Шильцин дал указание об отплытии сухогруза. Спустя шесть часов «Амурская» затонула в акватории залива Удская губа Охотского моря.
На борту судна находилось 10 человек. Позднее было обнаружено тело мужчины, не являющегося членом экипажа судна. Личность его не установлена. Два моряка признаны умершими, судьба еще семи членов экипажа осталась неизвестной.