В структуре Минкультуры Якутии действуют следующие подразделения:
- управление организации архивного дела и взаимодействия с муниципальными образованиями;
- отдел развития профессионального искусства и кино, отдел духовного развития и взаимодействия с творческими союзами;
- финансово-экономический отдел, курирующий вопросы госпрограммы культуры и искусства, финансовое обеспечение отрасли;
- управление по организационным и правовым вопросам, государственной службы и кадров.