Переход со спецрежимов к упрощенной системе налогообложения (УСН) приведет к тому, что «налоговая нагрузка увеличится в разы и сделает доходность бизнеса значительно меньшей, а в большинстве случаев приближенной к нулю». В «Опоре России» отметили, что «при переходе с патента на УСН потери в прибыли индивидуального предпринимателя составят от 23 до 109 процентов в зависимости от товарооборота».
Президент «Опоры России» Александр Калинин уверен, что введение подобного запрета недопустимо, так как это «существенно ухудшит положение налогоплательщиков», которые занимаются розничной торговлей маркируемыми товарами: «Особенно в том случае, если они одновременно с маркируемыми товарами реализуют товары, не подлежащие маркировке». Также Калинин добавил, что запрет приведет к перераспределению доли рынка в пользу федеральных и международных торговых сетей.
В Центре развития перспективных технологий, который отвечает за маркировку товаров, также считают, что перед принятием изменений важно оценить их возможное влияние на каждую отрасль, чтобы избежать негативных последствий для бизнеса.