Основная проблема в том, что нет единого документа, где «до мелочей прописаны правила игры». Нынешняя система в корне отличается от той, что вводилась в 2006 году, когда ЕГАИС стала обязательной для производителей крепкого алкоголя.
Помимо некорректного считывания кодов с продукции, дистрибьюторы часто сталкиваются с тем, что получение каждой партии должно быть подтверждено системой ЕГАИС, а на это может уйти до трех дней в городах и до семи в сельских поселениях.
Система ЕГАИС с 1 января 2016 года заработала в оптовом секторе, розничный сегмент должен подключиться к системе с 1 июля. Как считает президент Союза виноделов и виноградарей Леонид Попович, на отладку всех процессов потребуется не несколько месяцев.