Уголовное дело против Васильевой состоит из нескольких эпизодов, расследованных в рамках 29 уголовных дел. Завершено расследование 12 эпизодов ее деятельности в Минобороны. Общий ущерб только по этим эпизодам, по оценке следствия, превышает 3 млрд рублей.
В большинстве эпизодов, по которым проходит обвиняемой Евгения Васильева, говорится о продаже по заниженной цене недвижимости или земельных участков, принадлежащих Минобороны.