Из-за того, что максимальный срок содержания под домашним арестом составляет год, а следствие все еще продолжается, Шамхалов остался под подпиской о невыезде. Вместе с тем, УПК предполагает домашний арест на срок больше года для обвиняемых в особо тяжких преступлениях.
Шамхалов обвиняется в мошенничестве в особо крупном размере (это преступление относится к категории тяжких, а не особо тяжких) на сумму около 1,5 миллиарда рублей.
По данным следствия, по сговору с неизвестными лицами он похитил кредитные средства, выделенные Внешэкономбанком компании «Заречье 2» (бывший глава ВАК является совладельцем «Заречье Сетунь», которая, в свою очередь, является совладельцем «Заречья 2»). В 2006 году компания получила деньги на строительство элитного жилого комплекса, однако строительство не было завершено, а кредит не был выплачен.
Следствие полагает, что Шамхалов с сообщниками обналичивал деньги через фирмы-однодневники.