Наиболее остро нехватка ощущается в железнодорожном, воздушном и водном транспорте. Дефицит ощущается, в основном, специалистов «среднего звена» по техническим специальностям. Сегодня в транспортной отрасли занято около 25 тысяч человек.
В железнодорожном транспорте республики сегодня работает 914 человек. Однако с вводом в эксплуатацию железной дороги Беркакит – Томмот – Нижний Бестях потребность в железнодорожниках Якутии резко возрастет. По прогнозу министерства, дополнительная потребность в кадрах составит 1107 человек. Из них 80 процентов составят технические рабочие специальности. Несмотря на то, что подготовка специалистов во вновь открывшемся Транспортном техникуме в поселке Нижний Бестях будет увеличена с 77 до 125 человек, руководство Минтранса не исключает, что в первое время придется частично привлекать квалифицированные рабочие кадры из-за пределов республики на работу вахтовым методом.
В последние годы отмечается также нехватка летного и инженерно-технического состава в авиации Якутии. По этой причине вдвое был увеличен целевой заказ на подготовку этих специалистов. С 2012 года открывается летная специальность в Якутском авиационно-техническом училище. В связи с заменой воздушных судов на "Боинги" около 30 человек летного и инженерно-технического составов ежегодно обучаются за рубежом. В то же время в связи с выводом из эксплуатации судна Ту-154 возникают проблемы с трудоустройством высвобождаемых штурманов и бортинженеров.
В водном транспорте республики основной проблемой сегодня является старение командного состава флота. Средний возраст здесь составляет 50-55 лет. Не хватает кадров для комплектации плавсостава судов, особо остро стоит вопрос обеспечения специалистами морских профессий. Поэтому в Якутском филиале Новосибирской государственной академии водного транспорта будет открываться отделение по обучению морским специальностям: судоводители, судомеханики и электромеханики.
Кадры для транспортной отрасли республики сегодня готовят автодорожный факультет СВФУ, Якутское авиационно-техническое и Якутское командное речное училища, Транспортный техникум в поселке Нижний Бестях. Специалисты с начальным профессиональным образованием готовятся в Пеледуйском, Жатайском, Алданском и Нерюнгринском лицеях.