Сегодня пассажирский флот республики представлен судами 1960-1980-х годов постройки, что в несколько раз превышает нормативный срок эксплуатации судов. Основательно поизносился и такой социально востребованный высокоскоростной пассажирский транспорт, как суда на подводных крыльях - «Ракета», «Метеор» и «Заря». На северных реках Яна, Индигирка, Колыма их вообще давно нет. В Ленском бассейне осталось всего 14 скоростных судов, они эксплуатируются более 30 лет, износ составляет более 87%.

Финансовое состояние предприятий водного транспорта, обслуживающих пассажирские перевозки, не позволяет их развивать за счет собственных средств. Как отметил Анатолий Скрыбыкин, «в настоящее время водные перевозки пассажиров в целом убыточные и поэтому ежегодно субсидируются из республиканского бюджета в сумме свыше 20 миллионов рублей. При этом затраты по эксплуатации малоэффективных устаревших судов увеличиваются с каждым годом, растут расходы на техническое обслуживание, на приобретение запасных частей, на энергоносители».
В ситуации, когда перспективы замены устаревшего флота в этой ситуации чрезвычайно призрачны и остановка всего скоростного пассажирского флота республики становится неизбежной, требуется принятие кардинальных мер.
По словам министра транспорта дорожного хозяйства республики Семена Винокурова, свое видение по обновлению пассажирского флота уже представили речные компании в виде ряда проектов. Среди них проекты внедрения на реки республики скоростного пассажирского судна катамаранного типа на 36 пассажиров, сборку которого можно в принципе обеспечить в Якутске, а также высокоскоростной амфибийной системы «Буревестник-24» для внутренних водных путей, испытания которой пройдут уже этим летом. Перспективными представляются проекты по созданию скоростного грузопассажирского теплохода «Лотос» на воздушной подушке и пассажирского теплохода «Коч-2100».
Руководство отрасли видит выход из сложной ситуации в разработке стратегической программы обновления пассажирского флота и его развитие на основе государственно-частного партнерства. Правительство республики поддерживает это предложение и уже создает рабочую группу по подготовке проекта будущей программы.