За декабрь 2012 года партнерские авиакомпании – «Якутия», «ЮТэйр» и Red Wings - доставят к месту назначения более 2 500 пассажиров «Кубани». «Якутия» осуществляет перевозку по маршрутам Краснодар-Стамбул, Краснодар-Москва, Краснодар-Тель-Авив и Краснодар-Ереван.
В 2013 году перевозка пассажиров силами партнеров продолжится. Согласно действующим правилам, партнерские компании принимают на свои рейсы пассажиров с авиабилетами «Кубани» при наличии свободных мест.