5 июня на борту самолета АН-140, выполнявшего рейс 495 по маршруту Якутск - Хабаровск, произошла техническая неполадка, в связи с чем произошла задержка рейса 509 Хабаровск – Магадан.
В тот же день было направлено другое воздушное судно из Якутска в Магадан, однако по причине существующего в аэропорту Хабаровска регламента на полеты, вылет был осуществлен только на следующий день.
Все это и привело к общей задержке рейса более чем на двадцать часов. Всем пассажирам на время ожидания неоднократно предоставлялось горячее питание, они были размещены в гостинице.
Сейчас над установлением причины технической неисправности работает специально созданная комиссия Хабаровского управления воздушного транспорта.