Эйфман Борис Яковлевич родился 22 июля 1946 года в семье мобилизованного перед войной в Алтайский край из Бессарабии на строительство завода танковых двигателей инженера Янкеля Борисовича Эйфмана и врача Клары Марковны Эйфман. В 1951 году семья вернулась в Кишинёв, где Борис Эйфман закончил вечернюю школу и занялся балетом в студии при Дворце пионеров. В 1960 году поступил на впервые организованное в том году хореографическое отделение Кишинёвского музыкального училища по классу Рашель Иосифовны Бромберг, одновременно перенял у Бромберг руководство хореографической студией при Дворце Пионеров, в которой некогда начались и его занятия танцем. Окончил Кишинёвское музучилище в 1964 году, а в 1972 году — балетмейстерское отделение Ленинградской государственной консерватории имени Римского-Корсакова.
Первые постановки Эйфман осуществил в 1970 году (балеты «Жизни навстречу» на музыку Д.Б.Кабалевского и «Икар» на музыку А.Чернова и В.Арзуманова), затем последовали «Блестящий дивертисмент» (1971) на музыку М.И.Глинки, «Фантазия» (1972) на музыку Антония Аренского, «Гаянэ» на музыку А.И.Хачатуряна (1972, дипломная работа), — на сцене Малого театра оперы и балета в Ленинграде.
С 1971 по 1977 год работал балетмейстером в Ленинградском Академическом хореографическом училище имени А.Я.Вагановой (ныне Академия русского балета им. А.Я.Вагановой) и продолжил постановки на сцене Ленинградского государственного академического Театра оперы и балета имени С.М.Кирова: «Русская симфония» (1973) на музыку В.Калинникова, «Встречи» (1975) на музыку Р.К.Щедрина, «Жар-птица» (1975) на музыку И.Ф.Стравинского, «Прерванная песня» (1976) на музыку И.Калныньша, «…Души прекрасные порывы» (1977) на музыку Р.Щедрина.
В 1977 году Эйфману удалось создать собственный театр «Новый балет» при Ленконцерте, который уже в 1990-е годы был переименован в Санкт-Петербургский государственный академический Театр балета под руководством Бориса Эйфмана, и которым он руководит по сей день. Авторский театр, даже несмотря на отсутствие постоянного помещения, был для того времени в Советском Союзе явлением уникальным. Уже в конце 1970-х годов Эйфманом были поставлены спектакли «Только любовь» на музыку Родиона Щедрина, «Искушение» по композициям группы Yes (главным образом Рика Уэйкмана), «Под покровом ночи» на музыку Белы Бартока, «Прерванная песня» на музыку И.Калныньша, «Двухголосие» по ранним композициям группы Pink Floyd (главным образом за авторством Сида Баррета), «Жар-птица» (1978) на музыку И.Стравинского и «Вечное движение» (1979) на музыку А.Хачатуряна.
К концу 1980-х годов театр стал выезжать на гастроли в Нью-Йорк, которые со временем стали ежегодными. Всего Эйфманом на сегодняшний день уже создано более 40 балетных постановок.
В 2012 году Эйфман стал доверенным лицом кандидата в Президенты РФ В.В.Путина, выставившего свою кандидатуру на третий президентский срок.
