Закон создает правовую базу для перехода к формированию бюджетов на основе программно-целевого принципа и реализации отдельных мероприятий программы правительства по повышению эффективности бюджетных расходов.
Законом вводятся нормы о предоставлении бюджетных кредитов на пополнение остатков средств на счетах региональных /местных/ бюджетов и изменение механизма управления остатками на единых счетах по учету средств бюджетов. Предусматривается обязательная проверка соблюдения условий, целей и порядка предоставления субсидий, бюджетных кредитов их получателями. Субсидии и бюджетные кредиты будут предоставляться только при согласии их получателей на такую проверку. В случае просрочки возврата бюджетного кредита взыскание задолженности, пени и штрафов может быть обращено только на средства, еще не поступившие должнику-субъекту РФ.
Срок рассмотрения проекта федерального бюджета в Госдуме увеличивается с 55 до 60 дней, при этом исключаются ограничения по срокам между чтениями. Действующая редакция Бюджетного кодекса отводит на рассмотрение проекта бюджета в первом чтении 20 дней, во втором - 25 дней, в третьем - 10 дней.
Средства Фонда национального благосостояния могут размещаться в российские ценные бумаги, связанные с реализацией самоокупаемых инфраструктурных проектов, перечень которых утверждается правительством РФ. Субъект РФ, планирующий осуществить внешние заимствования, сначала должен согласовать свой выход на внешний рынок с Минфином России.
Изменения в Бюджетный кодекс и Налоговый кодекс должны будут приниматься отдельными законами. Они не могут быть включены в тексты законов, предусматривающих изменения и в другие законодательные акты.