В отношении спикера облдумы были возбуждены три уголовных дела, впоследствии объединенные в одно. Следствие считает, что Шамбир похитил с предприятия "Кандалакшский опытный машиностроительный завод", который ранее возглавлял, более 42 миллионов рублей, а также совершил хищение денежных средств путем обмана в особо крупном размере на сумму не менее 26 миллионов рублей, принадлежащих одному из банков.
Партия «Единая Россия» приостановила его членство в январе 2014 года. Тогда же Шамбир был временно отстранен от должности председателя Мурманской областной думы.