Премии участникам проектной деятельности выплачиваются по результатам достижения показателей эффективности, которые были утверждены на старте проекта, как персональных, так и проектных. Причем бонус руководителя больше зависит от успеха всего проекта (и, соответственно, должен выплачиваться в основном по итогам года), а рядового участника - от личного вклада.
Размер премий также пропорционален объему трудозатрат в рамках проекта: для частично участвующих в проектах премия формируется из проектной и непроектной составляющей. Соответственно, в некоторых случаях вся премия определяться проектными правилами. Речь не идет о дополнительных деньгах, премии идут из уже выделенных в ведомствах премиальных фондах за решение особо важных и сложных задач.