Дело о незаконной продаже акций "Башнефти" было возбуждено в апреле 2014 года. В августе по факту продажи акций БашТЭКа АФК "Система" было возбуждено еще одно уголовное дело по статье о легализации денежных средств, приобретенных преступным путем.
Рахимову заочно предъявлено обвинение по статье "присвоение или растрата и легализация денежных средств, приобретенных преступным путем". Он объявлен в международный розыск после того, как Басманный суд Москвы заочно арестовал его.