Осенью прошлого года, незадолго до своей отставки, чиновник обратился в органы: по словам Соболенко, неизвестные обстреляли окна его квартиры из автомата, чтобы запугать. Правоохранители возбудили дело о хулиганстве, после чего были арестованы предполагаемый организатор нападения, 32-летний уроженец Псковской области Сергей Рокотов, а также его подельники ‒ братья Алексей и Александр Груздевы и Михаил Васюк. Однако в ходе дальнейшего расследования версия Соболенко подтверждения не нашла и была полностью опровергнута собранными сведениями.
В конце октября 2013 года Соболенко был осужден на три года условно за рукоприкладство в отношении посетителей, пришедших к нему на прием, и покинул госслужбу. Кроме того, ранее мужчину проверяли на предмет причастности к убийству архитектора Всеволожского района Эдуарда Акопяна.