Установлено, что в июне 2004 года Пеунков организовал покушение на своего бизнес-конкурента Константина Быкова: автомобиль предпринимателя расстреляли из автоматов на перекрестке улиц Кировская и Мостовая в Архангельске. В результате Быков и один из его охранников погибли, второй сопровождающий получил тяжелые ранения.
Пеунков, кроме того, обвиняется в совершении ряда тяжких и особо тяжких преступлений, в частности, в организации преступного сообщества и принуждении к совершению сделок.