В нынешней должности генерал-лейтенант юстиции Кожокарь не проработал и года. Следственный департамент МВД РФ он возглавил 11 июня 2011 года, когда бывший в то время президентом Дмитрий Медведев произвел крупнейшую за последние годы кадровую перетряску в верхних эшелонах МВД. Тогда лишились постов первый заместитель министра Михаил Суходольский, заместитель министра Евгений Школов, заместитель министра—начальник следственного комитета ведомства Алексей Аничин, а также руководитель главного управления МВД по Санкт-Петербургу и Ленинградской области Владислав Пиотровский.
На место господина Кожокаря, который считался протеже экс-президента Медведева (они одновременно учились в Ленинградском госуниверситете), прочат бывшего заместителя руководителя следственного департамента Юрия Алексеева, который лишился поста вместе с генералом Аничиным. В последнее время он работал начальником управления Генпрокуратуры по надзору за исполнением законов о федеральной безопасности, межнациональных отношениях и противодействии экстремизму.
Алексеева характеризуют как профессионала своего дела, бессребреника, не связанного ни с какими кланами и бизнес-структурами, который как нельзя кстати подходит под ту модель управленцев МВД, которую сейчас выстраивает генерал Колокольцев.
