В сезоне 2013/2014 годов зарплаты и премии футболистам ФК "Якутия", выступающего во II дивизионе, зона "Восток", будут платить из бюджета республики. Субсидии будут выделяться по программе "Реализация молодежной политики, развитие физической культуры и спорта в Республике Саха (Якутия) на 2012-2016 годы" и расходоваться на зарплаты и премии футболистам, тренерам, медперсоналу, оплату услуг судейских бригад, питание, командировки и прочие расходы, включая изготовление рекламы и программок футбольных матчей.
Общая сумма бюджетных субсидий на содержание ФК "Якутия" в постановлении не указана. По словам начальника команды Анатолия Самкова, годовой бюджет клуба в сезоне 2012/2013, составлял 40 млн. рублей без учета зарплат и премиальных, которые платились из спонсорских денег, сообщает onedivision.ru.