Следствием установлено, что в 2011 году злоумышленниками создали дочернее юридическое лицо, на счета которого на протяжении двух лет выводились денежные средства предприятия под видом оплаты исследований, проводимых якобы в интересах ФГУПа, в том числе по линии гособоронзаказа.
По факту мошенничества в 2014 году возбуждено уголовное дело, в ходе расследования которого собраны доказательства о причастности фигурантов к созданию организованного сообщества. По подтвержденной информации, координацию действий осуществляли первый заместитель генерального директора ФГУП «НПО им. С.А.Лавочкина» по финансам и заместитель по персоналу.
Оперативно-разыскные мероприятия по установлению иных лиц, причастных к схеме хищения денежных средств предприятия продолжаются.