Следователь в суде пояснила, что Евстратову инкриминируется два эпизода хищения бюджетных средств, выделенных на проектирование и строительство объектов ядерной безопасности в Мурманске и научные разработки.
По данным следствия, Евстратов действовал в сговоре с директорами, отвечающими за ядерную энергетику Федеральных государственных предприятий, всего у него было три соучастника - начальник одного из департаментов Росатома Сергей Колобаев, директор ФГУП Федеральный центр ядерной безопасности Казакова и гендиректора питерского ГУП Аварийно-технического центра (ГУП АТЦ СПБ) Стокбур.