Основной целью создания новой ООПТ стало сохранение восточносибирской популяции стерха. Стерх, или белый журавль (якутское название стерха - «кыталык») внесен в Международную Красную книгу как вид, находящийся под угрозой исчезновения, и как редкий вид - в Красную книгу РФ. До недавнего времени вид был представлен тремя отдельными популяциями (западная, центральная и восточная). Будущее вида теперь зависит от сохранения восточносибирской популяции стерха, которая насчитывает около 4 000 особей (99 процентов его мировой численности) и гнездится в тундровой зоне на севере Якутии, на территории, предлагаемой к включению в состав нацпарка «Кыталык». Рассматриваемая территория является ключевой орнитологической территорией международного значения.
Вместе с тем, создание национального парка направлено на сохранение эталонных тундровых ландшафтов Яно-Индигирской низменности, редких и исчезающих видов животных, включая яно-индигирскую популяцию дикого северного оленя, поддержание традиционного природопользования коренных народов Севера и развитие экологического туризма.
На территории проектируемого национального парка отмечено произрастание 273 видов сосудистых растений, в т.ч. редких - родиола розовая, белозор Коцебу, мытник Пеннелля, вздутоплодник мохнатый.
Из позвоночных животных на территории национального парка отмечен 21 вид млекопитающих и 91 вид птиц, 63 из них - гнездящиеся. Здесь располагаются гнездовья включенных в Красную книгу РФ стерха, белоклювой гагары, пискульки, малого лебедя, клоктуна, кречета, сапсана, места массовой линьки водоплавающих птиц. Кроме того, встречаются волк, песец, росомаха, ондатра, представители отряда грызунов, отмечаются заходы дикого северного оленя, лося, соболя, горностая, ласки, бурого медведя, а также овцебыка, занесенного в Красную книгу Республики Саха (Якутия).
В целях поддержания традиционного образа жизни местного населения на территории нацпарка, в соответствии с законодательством, будет выделена зона традиционного экстенсивного природопользования. При этом рыбопромысловые участки для осуществления промышленного рыболовства, сформированные на территории Аллаиховского района, исключены из границ проектируемого нацпарка «Кыталык».
