В Управление Роспотребнадзора по РС(Я) 18 ноября 2014 года обратился гражданин, сообщив о пищевом отравлении, полученном им в этом кафе. Сотрудники отдела санитарного надзора, лицензирования и регистрации Управления Роспотребнадзора по Республике Саха (Якутия) провели по его заявлению проверку деятельности кафе и назначили санитарно-эпидемиологические экспертизы. В итоге были выявлены нарушения санитарно-гигиенических правил и норм, свидетельствующие о наличии реальной угрозы причинения вреда жизни и здоровью посетителей кафе.
По этой причине деятельность кафе «Иссык Куль» приостановлена на тридцать суток. За подобное нарушение это кафе уже подвергалось подобному наказанию в августе 2014 года.