Журналистка была убита в начале октября 2006 г. в Москве. Преступник поджидал Политковскую на лестничной площадки первого этажа дома, где она жила. Журналистка приехала из магазина на своей машине, взяла часть пакетов с продуктами и отнесла их в квартиру. После того, как вернулась за другими сумками, при выходе из лифта, убийца выстрелил ей один раз в грудь, после чего сделал контрольный выстрел в голову.
9 июня 2014 года Мосгорсуд признал Лом-Али Гайтукаева, Сергея Хаджикурбанова, Рустама Махмудова, Джабраила Махмудова и Ибрагима Махмудова виновными в убийстве обозревателя «Новой газеты» Анны Политковской и других преступлениях.
Суд приговорил Гайтукаева и Рустама Махмудова к пожизненному лишению свободы, Джабраила Махмудова – к 14 годам лишения свободы, Ибрагим Махмудов осужден на 12 лет лишения свободы, а Хаджикурбанов – на 20 лет лишения свободы.
Адвокаты, считая вину осужденных недоказанной, обжаловали приговор в вышестоящей инстанции, где было установлено следующее.
В июне-июле 2006 года Гайтукаев, получив от неустановленных лиц «заказ» на убийство обозревателя «Новой газеты» Политковской, создал организованную группу, в которую вовлек своих племянников – трех братьев Махмудовых и своего знакомого Хаджикурбанова.
Для осуществления своих преступных целей участники организованной группы приобрели автотранспорт и средства мобильной связи. Затем через Павлюченкова, являвшегося одним из руководителей оперативно-поискового управления ГУВД г.Москвы, достали пистолет с глушителем и боеприпасы к нему (осужден ранее в связи с заключением досудебного соглашения).
7 октября 2006 года примерно в 16 часов 12 минут Рустам Махмудов проник в подъезд дома, где жила журналистка, и когда она вошла в кабину лифта, выстрелил в нее 5 раз из пистолета с глушителем.
Судебной коллегией по уголовным делам из обвинения был исключен квалифицирующий признак «передача оружия».
Приговор в отношении Джабраила Махмудова был изменен, наказание по совокупности преступлений снижено на 2 месяца. В остальной части приговор оставлен без изменения.
Справка:

Политковская Анна Степановна (урожденная Мазепа; 30 августа 1958, Нью-Йорк - 7 октября 2006, Москва) – российская журналистка и правозащитница.
Родилась в Нью-Йорке, где ее родители находились на дипломатической работе.
Отец, Степан Федорович Мазепа, родился в селе Костобоброво Семеновского района Черниговской области, работал сотрудником миссии Украинской ССР при ООН.
В 1980 году окончила факультет журналистики МГУ им. М.В.Ломоносова.
В начале 1990-х Политковская получила гражданство США согласно принципу jus soli, оставшись при этом и гражданкой России.
В 1982-1993 годах работала в газетах "Известия" и "Воздушный транспорт", в творческом объединении "ЭСКАРТ", издательстве "Паритет".
До 1994 года являлась обозревателем еженедельника "Мегаполис Экспресс".
В 1994-1999 годах - обозреватель, редактор отдела чрезвычайных происшествий "Общей газеты".
С 1999 года - обозреватель "Новой газеты". Политковская неоднократно выезжала в районы боевых действий.
Награды за журналистскую деятельность:
2000 год - премия "Золотое перо России".
2000 год - диплом "Золотой гонг-2000" за серию материалов о Чечне.
2001 год - премия Союза журналистов РФ "Добрый поступок - доброе сердце".
2001 год - премия "Эмнести Интернэшнл" за правозащитную журналистику (Global Award for Human Rights Journalism).
2001 год - премия имени Артема Боровика за лучшие журналистские расследования (учреждена телекомпанией CBS и еженедельником "US News and World Report" совместно с "Зарубежным пресс-клубом Америки", вручается в Нью-Йорке).
2001 год - премия Союза журналистов РФ за материалы по борьбе с коррупцией.
2002 год - премия Фонда имени А.Д.Сахарова "За журналистику как поступок" (учреждена правозащитником Петром Винсом).
2002 год - премия Международного женского фонда по делам печати "За мужество в журналистике" - за репортажи о войне в Чечне.
2003 год - ежегодная премия ОБСЕ "За журналистику и демократию" - "в поддержку смелой и профессиональной журналистики, за права человека и свободу СМИ".
2003 год - премия Lettre Ulysses Award (англ. Lettre Ulysses Award) - за книгу репортажей, опубликованную на французском языке под названием "Чечня - позор России".
2003 год - медаль и премию имени Хермана Керстена (немецкий ПЕН-центр) - за мужественное освещение событий в Чечне. [81]
2004 год - премия Улофа Пальме (Стокгольм).
2005 год - премия "Свободы и будущего прессы" (Лейпциг).
2006 год (посмертно) - премия Артема Боровика "За мужество" (учреждена Благотворительным фондом имени Артема Боровика, Москва).
2006 год (посмертно) - медаль Уполномоченного по правам человека в РФ "Спешите делать добро".
2006 год (посмертно) - международная литературная премия имени Тициано Терцани за 2007 год.
2007 год (посмертно) - премия ЮНЕСКО за вклад в дело свободы печати за мужество при освещении событий в Чечне.
2007 год (посмертно) - премия "За развитие демократии", вручаемая журналистам, которые рискуют жизнью ради того, чтобы предоставить своим читателям или слушателям правдивую информацию.
2007 год (посмертно) - премия имени антифашистов Ганса и Софи Шолль.
2007 год (посмертно) - почетное членство в обществе Эриха Марии Ремарка.