Ведомство нашло ряд нарушений, в том числе связанных с проектом строительства завода "Лиотех". Так, в мае 2013 года СП представила отчет по итогам проверки деятельности "Роснано" и ее проектных компаний. В отчете, в том числе, отмечается, что в конце 2012 года размер задолженности "Лиотех" по процентам перед "Роснано" составил 1,54 млрд рублей, но компания продлила льготный период по процентам на 10 месяцев.
Ранее один из экспертов "Роснанотех" усомнился в нанотехнологической направленности проекта "Лиотех", его научной обоснованности и технической реализуемости.