Под подозрение в организации бунта в ЛИУ №3 попали двое авторитетных заключенных — Мустафаев и Салов, отбывающие 20- и 25-летний срок за убийства, разбои и грабежи. Ранее они отбывали наказание в другом учреждении — ЛИУ №10, где являлись неформальными лидерами среди заключенных.
За несколько недель до бунта они были перевезены в ЛИУ №3 и сразу же были помещены в штрафной изолятор, где стали активно готовить бунт против так называемых активистов, сотрудничавших с администрацией.
Осужденные из окружения «авторитетов» связались со своими родственниками и попросили наладить контакты с правозащитниками и предупредить их о начале акции. Кроме того, в региональное ОНК и нижегородские правозащитные организации из колонии были направлены десятки жалоб на жестокое обращение.
6 мая сторонники авторитетов выбежали из своих бараков, вооружившись кольями и ножками от стульев, и стали нападать на дневальных. Началась массовая драка, в результате которой 1 человек погиб и более двух десятков были ранены.