По данным следствия, в 2013 году Попов дал незаконное указание подчиненным сотрудникам об уменьшении площади застройки здания школы №35, предназначенной для обучения инклюзивных детей. Здание школы не было построено, а незаконно освобожденный земельный участок был использован для строительства частной компанией многоквартирного жилого дома.
Кроме того, по данным следствия, корректировка проектно-сметной документации здания школьного учреждения при отсутствии законных оснований повлекла расходование бюджетных средств на сумму около 1 млн рублей.
Егор Попов был уволен из окружной администрации по собственному желанию в апреле 2016 года. Осенью следствием были получены достоверные данные о том, что после начала совместной проверки прокуратуры и УЭБиПК подозреваемый приобрел авиабилет в Москву и намерен выехать за границу. Попытка выехать за пределы республики была пресечена совместными действиями оперативных сотрудников МВД и следователей Следственного комитета. 28 октября суд постановил заключить подозреваемого под стражу.
Адвокат подозреваемого подавал апелляции на решение городского суда, но это ходатайство было отклонено.
В декабре против Егора Попова было возбуждено еще одно уголовное дело. По версии следствия, Попов незаконно получил в собственность земельный участок на улице Билибина, который спустя несколько лет продал за 4 млн рублей. Экс-чиновник предоставил в МФЦ документы, что в его собственности имеется недостроенный дом без оформленной земли, после чего получил документы на землю. Однако, как выяснили следователи, недостроенный дом находится на другом земельном участке и не имеет отношения к участку на улице Билибина.
Справка:

Попов Егор Сергеевич родился 2 мая 1980 года в Якутске. В 2003 году окончил финансово-экономический институт ЯГУ.
В 1998 г. - менеджер торгового зала магазина "Reebok".
В 2001-2002 гг. - главный специалист секретариата Северного форума в г.Якутске.
В 2003-2006 гг. - ведущий специалист, главный специалист отдела территориальных бюджетов Департамента межбюджетных отношений Министерстве финансов РС(Я).
В 2006 г. - помощник Министра финансов РС(Я).
В 2007-2010 гг. - помощник Руководителя Администрации Президента и Правительства РС(Я).
В 2010-2012 гг. - руководитель управления Министерства финансов РС(Я) в Якутске.
2 апреля 2012 г. был назначен заместителем главы по экономике и финансам городского округа "город Якутск".
Награжден благодарностью Президента Республики Саха (Якутия).